Fakultas Ilmu Komputer (FIKOM) Universitas Yapis Papua memiliki visi untuk menjadi fakultas Islam yang maju, mandiri, berkualitas, dan berkontribusi terhadap pengembangan teknologi informasi dan ilmu komputer pada tahun 2028. Untuk mencapai visi tersebut, FIKOM telah menetapkan berbagai misi strategis yang menjadi landasan dalam menyusun sasaran dan strategi pencapaian. Dengan berfokus pada pendidikan, penelitian, pengabdian masyarakat, dan penguatan tata kelola, FIKOM berkomitmen untuk menjadi pusat unggulan di kawasan Indonesia Timur.

• Peningkatan Kualitas Pendidikan dan Kurikulum. Pendidikan menjadi fondasi utama dalam mencapai visi FIKOM. Program studi Sistem Informasi dan Informatika dirancang untuk menghasilkan lulusan yang kompeten dan relevan dengan kebutuhan industri. Kurikulum berbasis Outcome-Based Education (OBE) dan Merdeka Belajar Kampus Merdeka (MBKM) diterapkan untuk memberikan fleksibilitas kepada mahasiswa dalam mengembangkan kompetensinya. Selain itu, pembelajaran berbasis proyek dan studi kasus nyata diterapkan untuk mengintegrasikan teori dan praktik secara optimal.
• Fokus pada Penelitian Terapan. Penelitian terapan menjadi prioritas utama FIKOM untuk memberikan solusi praktis bagi tantangan masyarakat Papua. Dengan membentuk pusat penelitian di bidang jaringan komputer, kecerdasan buatan, dan multimedia, FIKOM berupaya menghasilkan inovasi yang berdampak luas. Dosen dan mahasiswa didorong untuk berkolaborasi dalam penelitian yang menghasilkan publikasi di jurnal bereputasi nasional dan internasional.
• Pengabdian Masyarakat Berbasis Teknologi. FIKOM aktif melaksanakan program pengabdian masyarakat yang memanfaatkan teknologi informasi untuk meningkatkan literasi digital di komunitas lokal. Salah satu inisiatif utama adalah peluncuran program "Desa Cerdas," yang bertujuan untuk memberdayakan masyarakat melalui teknologi. Program ini mencakup pelatihan penggunaan aplikasi digital, pengembangan sistem informasi desa, dan pendampingan dalam transformasi digital.
• Penguatan Kemitraan Strategis. Dalam upaya meningkatkan relevansi kurikulum dan memperluas peluang bagi mahasiswa, FIKOM menjalin kerja sama dengan industri, pemerintah, dan lembaga penelitian. Kemitraan ini mencakup program magang, penelitian bersama, dan pengembangan kurikulum berbasis kebutuhan industri. Selain itu, FIKOM juga menjalin hubungan dengan universitas nasional dan internasional untuk memperkuat jejaring akademik.
• Pengembangan Kompetensi Dosen dan Staf. Kompetensi dosen dan staf menjadi kunci dalam menciptakan lingkungan akademik yang inspiratif. FIKOM secara rutin mengadakan pelatihan di bidang teknologi terkini, seperti kecerdasan buatan, keamanan siber, dan cloud computing. Selain itu, dosen didorong untuk mengikuti program sertifikasi profesional dan melanjutkan studi ke jenjang yang lebih tinggi.
• Penguatan Infrastruktur dan Fasilitas. Untuk mendukung proses belajar mengajar, FIKOM terus memperbarui infrastruktur dan fasilitasnya. Laboratorium komputer dilengkapi dengan perangkat lunak terbaru, dan akses internet diperkuat untuk mendukung pembelajaran berbasis digital. Selain itu, ruang kolaborasi dan inovasi dibangun untuk mendorong kreativitas mahasiswa dan dosen dalam mengembangkan solusi teknologi.
• Peningkatan Sistem Manajemen Akademik. FIKOM akan menerapkan sistem informasi akademik berbasis digital untuk meningkatkan efisiensi administrasi dan pengalaman belajar mahasiswa. Sistem evaluasi dan umpan balik yang efektif juga akan diimplementasikan untuk memastikan perbaikan berkelanjutan dalam layanan akademik.
• Pencapaian Akreditasi Unggul. Salah satu target utama FIKOM adalah meningkatkan akreditasi program studi Sistem Informasi dan Informatika. Strategi ini mencakup perbaikan kurikulum, peningkatan kualitas penelitian, dan penguatan kerja sama 16 dengan mitra eksternal. Akreditasi unggul diharapkan dapat dicapai sebelum tahun 2028.